Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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