Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptp4a3Q9D658 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptp4a3Q9D658 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptp4a3Q9D658 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms