Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc7Q9D541 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc7Q9D541 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc7Q9D541 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc7Q9D541 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc7Q9D541 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc7Q9D541 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc7Q9D541 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc7Q9D541 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc7Q9D541 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc7Q9D541 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc7Q9D541 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc7Q9D541 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc7Q9D541 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc7Q9D541 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc7Q9D541 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc7Q9D541 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc7Q9D541 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc7Q9D541 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms