Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3404Q9D506 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3404Q9D506 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3404Q9D506 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3404Q9D506 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3404Q9D506 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3404Q9D506 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3404Q9D506 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3404Q9D506 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3404Q9D506 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3404Q9D506 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3404Q9D506 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3404Q9D506 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3404Q9D506 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3404Q9D506 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3404Q9D506 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3404Q9D506 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3404Q9D506 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms