Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap53Q9D439 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cfap53Q9D439 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cfap53Q9D439 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cfap53Q9D439 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms