Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933425L06RikQ9D3Z8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933425L06RikQ9D3Z8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms