Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P2

5330417H12Rik, MCG147567, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5330417H12RikQ9D3P2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
5330417H12RikQ9D3P2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5330417H12RikQ9D3P2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5330417H12RikQ9D3P2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
5330417H12RikQ9D3P2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms