Protein–RNA interactions for Protein: Q9D260

9230112D13Rik, RIKEN cDNA 9230112D13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230112D13RikQ9D260 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
9230112D13RikQ9D260 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
9230112D13RikQ9D260 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
9230112D13RikQ9D260 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
9230112D13RikQ9D260 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms