Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q6

Erp44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp44Q9D1Q6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Erp44Q9D1Q6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Erp44Q9D1Q6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Erp44Q9D1Q6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Erp44Q9D1Q6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Erp44Q9D1Q6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Erp44Q9D1Q6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Erp44Q9D1Q6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Erp44Q9D1Q6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Erp44Q9D1Q6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erp44Q9D1Q6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erp44Q9D1Q6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erp44Q9D1Q6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erp44Q9D1Q6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erp44Q9D1Q6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erp44Q9D1Q6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 535 ms