Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cysrt1Q9D1E4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cysrt1Q9D1E4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cysrt1Q9D1E4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms