Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdca7Q9D0M2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdca7Q9D0M2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdca7Q9D0M2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdca7Q9D0M2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms