Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pbdc1Q9D0B6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pbdc1Q9D0B6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pbdc1Q9D0B6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbdc1Q9D0B6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbdc1Q9D0B6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbdc1Q9D0B6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbdc1Q9D0B6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbdc1Q9D0B6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbdc1Q9D0B6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbdc1Q9D0B6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms