Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snf8Q9CZ28 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snf8Q9CZ28 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snf8Q9CZ28 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snf8Q9CZ28 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snf8Q9CZ28 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snf8Q9CZ28 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms