Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prelid3bQ9CYY7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prelid3bQ9CYY7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prelid3bQ9CYY7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms