Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnih4Q9CX13 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnih4Q9CX13 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnih4Q9CX13 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnih4Q9CX13 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnih4Q9CX13 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnih4Q9CX13 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnih4Q9CX13 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnih4Q9CX13 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnih4Q9CX13 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnih4Q9CX13 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnih4Q9CX13 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnih4Q9CX13 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnih4Q9CX13 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnih4Q9CX13 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnih4Q9CX13 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnih4Q9CX13 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnih4Q9CX13 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnih4Q9CX13 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih4Q9CX13 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih4Q9CX13 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih4Q9CX13 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih4Q9CX13 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih4Q9CX13 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih4Q9CX13 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih4Q9CX13 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnih4Q9CX13 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnih4Q9CX13 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnih4Q9CX13 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih4Q9CX13 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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