Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufaf1Q9CWX2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ndufaf1Q9CWX2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufaf1Q9CWX2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms