Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx10Q9CWT3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snx10Q9CWT3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx10Q9CWT3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx10Q9CWT3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms