Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rhobtb3Q9CTN4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms