Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRC3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CRC3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9CRC3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9CRC3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CRC3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CRC3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CRC3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CRC3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CRC3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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