Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23,19■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23,18■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Ska2Q9CR46 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23,11■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23,11■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23,09■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23,08■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ska2Q9CR46 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ska2Q9CR46 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23,01■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22,96■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,27
Ska2Q9CR46 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Ska2Q9CR46 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22,95■■□□□ 1,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,2 ms