Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccer1Q9CQL2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccer1Q9CQL2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccer1Q9CQL2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccer1Q9CQL2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccer1Q9CQL2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccer1Q9CQL2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccer1Q9CQL2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccer1Q9CQL2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccer1Q9CQL2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccer1Q9CQL2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccer1Q9CQL2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccer1Q9CQL2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccer1Q9CQL2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccer1Q9CQL2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccer1Q9CQL2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccer1Q9CQL2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms