Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms