Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Med4Q9CQA5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Med4Q9CQA5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Med4Q9CQA5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Med4Q9CQA5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Med4Q9CQA5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Med4Q9CQA5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Med4Q9CQA5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Med4Q9CQA5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Med4Q9CQA5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Med4Q9CQA5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Med4Q9CQA5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms