Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA3

Sdhb, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhbQ9CQA3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SdhbQ9CQA3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SdhbQ9CQA3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SdhbQ9CQA3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SdhbQ9CQA3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SdhbQ9CQA3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SdhbQ9CQA3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SdhbQ9CQA3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SdhbQ9CQA3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SdhbQ9CQA3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms