Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc5Q9CQA1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc5Q9CQA1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc5Q9CQA1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc5Q9CQA1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc5Q9CQA1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc5Q9CQA1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc5Q9CQA1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc5Q9CQA1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc5Q9CQA1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc5Q9CQA1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trappc5Q9CQA1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc5Q9CQA1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc5Q9CQA1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc5Q9CQA1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc5Q9CQA1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc5Q9CQA1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms