Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4921530L21RikQ9CQ47 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4921530L21RikQ9CQ47 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms