Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc18Q9CQ07 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lrrc18Q9CQ07 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc18Q9CQ07 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms