Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atg3Q9CPX6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atg3Q9CPX6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atg3Q9CPX6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atg3Q9CPX6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atg3Q9CPX6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atg3Q9CPX6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atg3Q9CPX6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atg3Q9CPX6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atg3Q9CPX6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atg3Q9CPX6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atg3Q9CPX6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atg3Q9CPX6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atg3Q9CPX6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atg3Q9CPX6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atg3Q9CPX6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Atg3Q9CPX6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Atg3Q9CPX6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Atg3Q9CPX6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atg3Q9CPX6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Atg3Q9CPX6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atg3Q9CPX6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Atg3Q9CPX6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Atg3Q9CPX6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atg3Q9CPX6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atg3Q9CPX6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atg3Q9CPX6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atg3Q9CPX6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atg3Q9CPX6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atg3Q9CPX6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atg3Q9CPX6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atg3Q9CPX6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atg3Q9CPX6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Atg3Q9CPX6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Atg3Q9CPX6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atg3Q9CPX6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atg3Q9CPX6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atg3Q9CPX6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atg3Q9CPX6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atg3Q9CPX6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atg3Q9CPX6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms