Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf8Q99PV0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf8Q99PV0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Prpf8Q99PV0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms