Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NsmfQ99NF2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NsmfQ99NF2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NsmfQ99NF2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NsmfQ99NF2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NsmfQ99NF2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NsmfQ99NF2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NsmfQ99NF2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NsmfQ99NF2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NsmfQ99NF2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NsmfQ99NF2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NsmfQ99NF2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NsmfQ99NF2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms