Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rims1Q99NE5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rims1Q99NE5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rims1Q99NE5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rims1Q99NE5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rims1Q99NE5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rims1Q99NE5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rims1Q99NE5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rims1Q99NE5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Rims1Q99NE5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rims1Q99NE5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rims1Q99NE5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rims1Q99NE5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rims1Q99NE5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Rims1Q99NE5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rims1Q99NE5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rims1Q99NE5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rims1Q99NE5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rims1Q99NE5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rims1Q99NE5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rims1Q99NE5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rims1Q99NE5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rims1Q99NE5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rims1Q99NE5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rims1Q99NE5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rims1Q99NE5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rims1Q99NE5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Rims1Q99NE5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rims1Q99NE5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rims1Q99NE5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rims1Q99NE5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rims1Q99NE5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rims1Q99NE5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rims1Q99NE5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rims1Q99NE5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rims1Q99NE5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Rims1Q99NE5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rims1Q99NE5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rims1Q99NE5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rims1Q99NE5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rims1Q99NE5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rims1Q99NE5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rims1Q99NE5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rims1Q99NE5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rims1Q99NE5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms