Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acss1Q99NB1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acss1Q99NB1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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Acss1Q99NB1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Acss1Q99NB1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.7 ms