Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaja3Q99M87 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaja3Q99M87 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaja3Q99M87 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaja3Q99M87 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaja3Q99M87 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaja3Q99M87 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnaja3Q99M87 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaja3Q99M87 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Dnaja3Q99M87 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaja3Q99M87 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaja3Q99M87 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms