Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Krt84Q99M73 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Krt84Q99M73 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Krt84Q99M73 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26,99■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Krt84Q99M73 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Krt84Q99M73 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Krt84Q99M73 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Krt84Q99M73 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Krt84Q99M73 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Krt84Q99M73 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Krt84Q99M73 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Krt84Q99M73 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Krt84Q99M73 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Krt84Q99M73 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Krt84Q99M73 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
Krt84Q99M73 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Krt84Q99M73 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Krt84Q99M73 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Krt84Q99M73 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Krt84Q99M73 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Krt84Q99M73 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Krt84Q99M73 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,1 ms