Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdpd3Q99LY2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdpd3Q99LY2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms