Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pagr1aQ99L02 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pagr1aQ99L02 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pagr1aQ99L02 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pagr1aQ99L02 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pagr1aQ99L02 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pagr1aQ99L02 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pagr1aQ99L02 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms