Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp11Q99K46 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp11Q99K46 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp11Q99K46 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp11Q99K46 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp11Q99K46 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms