Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcd2Q99JR8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcd2Q99JR8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcd2Q99JR8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcd2Q99JR8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcd2Q99JR8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcd2Q99JR8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcd2Q99JR8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcd2Q99JR8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcd2Q99JR8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcd2Q99JR8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcd2Q99JR8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcd2Q99JR8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcd2Q99JR8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms