Protein–RNA interactions for Protein: Q99JP6

Homer3, Homer protein homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer3Q99JP6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Homer3Q99JP6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Homer3Q99JP6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Homer3Q99JP6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms