Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmd6Q99JI4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmd6Q99JI4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmd6Q99JI4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmd6Q99JI4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmd6Q99JI4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psmd6Q99JI4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psmd6Q99JI4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psmd6Q99JI4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psmd6Q99JI4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmd6Q99JI4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmd6Q99JI4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmd6Q99JI4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd6Q99JI4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd6Q99JI4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd6Q99JI4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd6Q99JI4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmd6Q99JI4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms