Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg5Q99J83 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg5Q99J83 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg5Q99J83 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg5Q99J83 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg5Q99J83 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg5Q99J83 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms