Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smc6Q924W5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smc6Q924W5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc6Q924W5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms