Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Letmd1Q924L1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Letmd1Q924L1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Letmd1Q924L1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms