Protein–RNA interactions for Protein: Q923Z4

Ferd3l, Fer3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ferd3lQ923Z4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ferd3lQ923Z4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ferd3lQ923Z4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ferd3lQ923Z4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms