Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp4Q921I6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3bp4Q921I6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp4Q921I6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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