Protein–RNA interactions for Protein: Q920E5

Fdps, Farnesyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FdpsQ920E5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FdpsQ920E5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FdpsQ920E5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FdpsQ920E5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FdpsQ920E5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FdpsQ920E5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FdpsQ920E5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FdpsQ920E5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FdpsQ920E5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FdpsQ920E5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FdpsQ920E5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms