Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx4Q91YJ2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx4Q91YJ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx4Q91YJ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms