Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdha7Q91Y13 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdha7Q91Y13 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha7Q91Y13 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha7Q91Y13 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha7Q91Y13 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms