Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps36Q91XD6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps36Q91XD6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps36Q91XD6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps36Q91XD6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms