Protein–RNA interactions for Protein: Q91X93

Prb1, Proline-rich protein BstNI subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prb1Q91X93 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prb1Q91X93 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prb1Q91X93 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prb1Q91X93 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prb1Q91X93 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prb1Q91X93 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prb1Q91X93 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prb1Q91X93 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prb1Q91X93 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms